Tunney nació en Chicago, Illinois, y se crió en el sur del mismo estado. Durante su primer año de preparatoria asistió a la St. Ignatius College Prep (Colegio Preparatorio de San Ignacio), un colegio católico romano en Chicago. Estudió interpretación en la Chicago Academy for the Arts.
Con 18 años, Tunney se mudó a Los Ángeles, California, y obtuvo unos cuantos papeles como personaje recurrente en series como Life Goes On (1989), Law & Order (1990), Dream On (1990) y Class of '96 (1993).

En 1997, Tunney actuó en Niagara, Niagara de Bob Gosse, junto con Henry Thomas ganando el premio a la Mejor Actriz en el Festival Internacional de Cine de Venecia de 1997. Tunney también actuó junto a Arnold Schwarzenegger en la película de acción de 1999 End of Days.
En 2000 trabajó en las películas Supernova y Límite vertical, teniendo en esta última uno de los papeles protagonistas.
En 2004 actuó en las películas Shadow of Fear y Paparazzi, realizando el papel coprotagonista en esta última, y también actuó en los 2 episodios piloto de la serie de Fox, House.
En 2005 interpretó al personaje de Veronica Donovan durante la primera temporada de la serie Prison Break y el primer episodio de la segunda.
El 4 de octubre de 1997, Tunney se casó con el productor y director Bob Gosse, pero se separaron a finales de 2002 y se divorciaron el 26 de enero de 2006. Desde el 15 de noviembre de 2007 está casada con el director de cine Andrew Dominik.